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学生风采

恒稳条件下蛋白质折叠的反应势垒&DNA解纠缠过程的微观机理研究

时间:2007-12-13

报告人:刘志荣 
 
报告人简介:
1997年毕业于清华大学物理系,2001年获清华大学理学博士学位(凝聚态物理)。2001-2007年先后于德国马普金属所、清华大学高等研究中心及加拿大多伦多大学从事博士后工作。2007年7月起任北京大学化学学院副教授、学术组长。目前研究兴趣主要集中于蛋白质折叠、DNA解纠缠及动力学模拟加速算法方面。 
 
报告摘要:
蛋白质折叠反应在水中的反应势垒随温度的变化而发生很大的改变(典型的非Arrhenius类型):反应速率的对数与温度的倒数并不服从线性关系。然而,通过同时调节温度与变性剂(denaturant)浓度从而使蛋白质的稳定性保持恒定,研究人员在几种蛋白质中观察到不随温度变化的反应势垒。这种现象是否是普遍存在的?为了回答这个问题,我们提出一种算法,利用已有文献中的实验数据,计算了十四种蛋白质在恒稳条件下的反应速率,证实了这所有的十四种蛋白质在恒稳条件下的反应势垒都不随温度变化。进一步地,我们通过分子动力学模拟揭示了疏水作用及协同效应是造成这种现象的重要微观原因。报告的第二部分应用格点模型研究了DNA解纠缠过程的微观机理。 
 
时间:2007年12月13日 16:00
 
地点:理论物理所新楼6420
 

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