05/19
2023
Seminar
- Title题目 蛋白质进化中的统计规律：基于AlphaFold数据库的研究
- Speaker报告人 唐乾元 (香港浸会大学物理系)
- Date日期 2023年5月19日 10:00
- Venue地点 线上: zoom meeting链接：https://us02web.zoom.us/j/83925282502?pwd=U1hiQnAveVoyVFJlbkduRmliMDRLdz09 会议号：839 2528 2502 密码：194928
Abstract摘要
统计物理方法与AI预测数据的结合为探索生命复杂系统的普适规律提供了全新的强大工具。以蛋白质进化问题为例，传统的蛋白质进化研究往往关注同一个家族的蛋白质序列或者结构（微观视角），而在有了AlphaFold预测的海量蛋白质的结构之后，研究者可以把视角扩展到大量蛋白质的集合，甚至是直接对比不同物种体内的全部蛋白质，从中挖掘统计趋势（宏观视角）。本次报告将介绍我们基于AlphaFold数据库进行研究的一些最新进展。通过对比40多种模式生物体内相似链长的蛋白质，我们发现了蛋白质分子进化中的统计规律：随着物种复杂度的提高，生物体内的蛋白质在进化中呈现出特定的统计趋势，蛋白质序列将趋向于出现更显著的亲疏水片段分隔，蛋白质结构将趋向于更高的柔性和模块化程度，蛋白质的功能专一性也不断提高。本研究在分子进化和物种进化之间建立了联系，有助于我们理解生物复杂性的演化。
报告人简介:
唐乾元，香港浸会大学物理系助理教授。南京大学本科（2011）及物理学博士（2017），曾经在日本东京大学和理化学研究所（RIKEN）等单位从事博士后研究。主要的研究方向为统计物理、理论生物物理和复杂系统。在Phys Rev Lett, Mol Biol Evol, Plos Comp Biol, Phys Rev Research 等杂志发表多篇论文。
邀请人：
王维康 副研究员
附件下载: